大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于猪lncRNA在细菌的问题,于是小编就整理了4个相关介绍猪lncRNA在细菌的解答,让我们一起看看吧。 1、lncrna全称?lncRNA,全称“长链非编码RNA”(long non-coding RNA),是近年来RNA方向的研究热门。以前只是各种听说,没正儿八经地做过lncRNA的测序分析。最近接到新任务,所以来了解了解,本人实在健忘,所以记下lncRNA的基础信息。lncRNA特点?1)长度在200-100000nt之间的RNA分子;2)具有mRNA样结构,有polyA尾巴和启动子样结构;3)不编码蛋白。在生信分析中,往往会去除有蛋白编码家族的转录本;去除有编码能力的RNA来筛选lncRNA;(工具:CPAT,CNCI,CPC,PLEK)为什么lncRNA要采用链特异性建库?熟悉lncRNA测序的朋友们肯定知道,lncRNA测序多采用链特异性建库。其原因为:1)lncRNA的来源是具有链特异性的;2)lncRNA来源就是编码蛋白(mRNA)基因的反义链,是传说中的天然反义lncRNA(NAT-antisense lncRNA);如果是普通非链特异性建库,那么序列是来自mRNA,还是NAT-antisence LncRNA就难以区分了;3)链特异性建库可更准确地统计转录本的数量和确定基因的结构,准确区分获得的转录本来自基因组哪条链。 2、rna的保守性是什么意思?lncRNA是非编码RNA,许多lncRNA位于基因间区,独立成为一个基因。在千百万年的进化中,并未消失。说明他们虽不通过编码蛋白发挥作用,可以发挥别的功能。神奇的是,许多lncRNA是物种保守的,说明其功能不是偶然的。 3、如何利用tcga数据库进行差异的lncrna分析?DataTable dt = new DataTable();dt.Columns.Add(new DataColumn(PreRevDate0, typeof(decimal)));DataColumn col = new DataColumn();col.ColumnName = PreRevDate1;col.Expression = ABS(Convert.ToInt32(PreRevDate0));col.DataType = typeof(decimal);dt.Columns.Add(col);DataRow dr = dt.NewRow();dr[PreRevDate0] = -1;dt.Rows.Add(dr); 4、为什么lncrna称为非编码rna?长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA(相应的蛋白编码RNA的比例是1%),虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛,但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的。 lncRNA是长链非编码RNA的简称,是长度在200-100000 nt之间的RNA分子。大多数的lncRNAs在组织分化发育过程中,都具有明显的时空表达特异性;序列上保守性较低,只有约12%的lncRNA可在人类之外的其它生物中找到。非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA,包括miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA等。非编码RNA发挥功能的方式很多,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种细胞活动,主要包括基因的激活和沉默,RNA的剪接、修饰和编辑,蛋白质的翻译等。 到此,以上就是小编对于猪lncRNA在细菌的问题就介绍到这了,希望介绍关于猪lncRNA在细菌的4点解答对大家有用。 |