一、病原体不同

猪囊虫病是由猪带绦虫幼虫（猪囊尾蚴）寄生于人体所致，而脑囊虫病则是由链状带绦虫（猪带绦虫）的幼虫（囊尾蚴）寄生于人脑所致。

二、传播途径不同

猪囊虫病患者是猪带绦虫的惟一宿主，因此该病的传播途径主要是通过粪口途径，例如患者误食了带有猪带绦虫卵的食物或水。而脑囊虫病则主要是由于患者食用了被链状带绦虫幼虫污染的食物或水而传播的。

三、病变部位不同

猪囊虫病主要侵犯人体的皮下组织和肌肉组织，尤其是四肢和躯干，表现为皮下结节或包块，伴有疼痛和压痛。而脑囊虫病则主要寄生于人脑组织中，表现为癫痫、头痛和呕吐等颅内压增高症状。

四、诊断方法不同

猪囊虫病的诊断可通过皮内试验、血清学检测和大便检测等方法进行。而脑囊虫病的诊断则需要进行影像学检查，如头颅CT或MRI等，以明确囊尾蚴所在的部位及其周围脑组织的情况。

五、治疗方法不同

猪囊虫病的治疗主要是通过手术将皮下结节或包块切除，同时服用抗寄生虫药物以清除体内的绦虫。而脑囊虫病则需要使用药物杀死囊尾蚴并降低颅内压，同时针对癫痫等症状进行对症治疗。

六、预防措施不同

猪囊虫病的预防主要是加强粪便管理，避免人畜共用便器，同时注意个人卫生，避免食用生猪肉和未煮熟的猪肉。而脑囊虫病的预防则需要加强粪便管理和肉类检验，避免食用带有绦虫卵的肉类食品。对于脑囊虫病患者还需要加强治疗和管理，避免疾病复发和传播。

猪囊虫病和脑囊虫病虽然都是由寄生虫感染所致，但它们在病原体、传播途径、病变部位、诊断方法、治疗方法和预防措施等方面都存在明显的差异。在日常生活中我们应该注意区分这两种疾病，及时就医并采取相应的治疗和预防措施。