生态养猪对猪舍结构的要求与传统猪舍基本相同。其特点是猪舍前后增设了空气对流窗，并合理设置了垫料池。应根据猪群的性别、年龄和生产目的建设各种专用猪舍，如育肥猪舍、保育猪舍、妊娠母猪舍、产房等。基本结构为：1条左右的走道猪舍内设有一定宽度（宽1.5-2.0米）的水泥饲养台，与饲养台相连的发酵床，南北墙设有大通风窗。方便猪舍避暑。屋顶安装天窗，以利于冬季水蒸气的排出。建议使用集饲喂、饮水于一体的自动饲槽。设置水泥饲喂平台的目的，一是防止垫料污染饲料，影响采食量；其次，在夏季高温季节，为猪提供在阴凉处躺卧休息的选择，减少发酵床过热对猪的影响；第三，有利于猪的四肢发育，这对于种猪尤其重要。 1、育肥猪舍：单排育肥猪舍比较合适，保证猪的阳光充足，活动面积大。一般为了降低猪舍成本，育肥猪舍除发酵床外，还可以采用塑料大棚式结构。现有猪舍也可以进行改造，只要满足夏季通风降温、冬季保温除湿的条件即可。 2、母猪舍：母猪舍分为妊娠舍和产仔舍（即产房）。妊娠猪舍可采用群养模式，产仔猪舍多采用产床或产床。猪舍建设，特别是产仔猪舍，对温度控制要求较高，应注意温度控制。 (1)妊娠猪舍：生态养猪的妊娠猪舍由于发酵垫料维护管理方便，往往适合大群饲养。有双排或单排结构可供选择。建筑跨度不太大，以自然通风为主。目前比较新颖的是采用母猪自动化饲喂系统与生态养猪相结合（2）产房：产仔猪舍。通过生态养猪方式扩大母猪和仔猪的活动范围一般有三种模式：一是母猪和仔猪均在产床上，粪便、尿液流入发酵垫料池。垃圾箱只起到分解粪便和尿液的作用。其次，产床限制了母猪，仔猪可以在产床或垫料池内活动。增加仔猪的活动范围，恢复其自然习性。仔猪可以选择休息和活动区域。第三个是无限制的隔栏，配有喂食台，以便妈妈和幼崽可以自由活动。 3、保育猪舍：保育猪舍结构与育肥猪舍相似，垫料厚度可适当减少。扩大了猪的活动范围，让它们可以尽情玩耍，恢复其生物习性。